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淺談臨床基因擴增檢驗PCR實(shí)驗室建設標準及配置

華銳凈化 2019-05-12 21:15:25 閱讀

根據《臨床檢驗擴增檢驗實(shí)驗室管理暫行辦法》,制定本標準
一、 臨床基因擴增檢驗實(shí)驗室區域設置原則    
 (一) 臨床基因擴增檢驗實(shí)驗室區域設置原則    
1、 試劑儲存和準備區     
2、 標本制備區
3、 擴增反應混合物配制和擴增區     
4、 擴增產(chǎn)物分析區      
如使用全自動(dòng)分析儀,區域可適當合并。      
(二)各工作區域必須有明確的標記,避免不同工作區域內的設備、物品混用。    
(三)進(jìn)入各工作區域必須嚴格按照單一方向進(jìn)行,即試劑儲存和準備區 —>標本制備區—>擴增反應混合物配制和擴增區—>擴增產(chǎn)物分析區。      
(四)不同的工作區域使用不同的工作服(例如不同的顏色)。工作人員離開(kāi)各工作區域時(shí),不得將工作服帶出。     
二、 工作區域儀器設備配置標準    
 (一) 試劑儲存和準備區     
1、2-8C和-15C冰箱     
2、混勻器      
3、微量加樣器(覆蓋1-1000ul)     
4、移動(dòng)紫外燈(近工作臺面)      
5、消耗品:一次性手套、一次性吸水紙、耐高壓處理的離心管和加樣器吸頭(帶濾心)    
 6、專(zhuān)用工作服和工作鞋    
 7、專(zhuān)用辦公用品     
(二) 標本制備區     
 1、2-8C冰箱、-20C或-80C冰箱   
2、高速臺式冷凍離心機     
3、混允器      
4、水浴箱或加熱模塊     
 5、微量加樣器(覆蓋1-1000ul)    
 6、可移動(dòng)紫外燈(近工作臺面)     
7、超凈工作臺      
8、消耗品:一次性手套、一次性吸水紙、耐高壓處理的離心管和加樣器吸頭(帶濾心)     
9、專(zhuān)用工作服和工作鞋     
10、專(zhuān)用辦公用品      
如需處理大分子DNA,應具有超聲波水浴儀。    
(三) 擴增反應混合物配制和擴增區
 1、 核酸擴增儀      
2、 微量加樣器(覆蓋1-1000ul)     
3、 可移動(dòng)紫外燈(近工作臺面)      
4、消耗品:一次性手套、一次性吸水紙、耐高壓處理的離心管和加樣器吸頭(帶濾心)     
5、 專(zhuān)用工作服和工作鞋     
6、 專(zhuān)用辦公用品     
(四)擴增產(chǎn)物分析區      
視檢驗方法不同而定?;緝x器設備如下:     
1、 微量加樣器(覆蓋1-1000ul)     
2、 可移動(dòng)紫外燈(近工作臺面)      
3、消耗品:一次性手套、一次性吸水紙、加樣器吸頭(帶濾心)     
4、 專(zhuān)用工作服和工作鞋     
5、 專(zhuān)用辦公用品      
為了對以個(gè)特定序列進(jìn)行PCR做重復檢測,需要三個(gè)不同的區域,每一個(gè)區域的具體技術(shù)操作和試劑在下面詳細列出.     
1、 樣品準備區      
這個(gè)區域專(zhuān)門(mén)用作樣品的準備,在制備和操作用于核酸提取的試劑時(shí)應該采     
取預防措施:      
1)PCR產(chǎn)物和帶有要擴增序列的DNA克隆不能在這個(gè)房間操作。     
 2)組織培養物、組織標本和血清樣品都帶進(jìn)樣品準備間處理,以根據應用的需要提取DNA或RNA。      
3)用于樣品處理的工具不能被用作普通分子克隆的工具,也不能用作操作靶序列。     
4)DNA樣品應該用有專(zhuān)門(mén)的防護或正壓活塞式移液管操作,以防止在吸取樣品時(shí)有氣溶膠遺留。      
5)大體積樣品應該用單獨包裝的無(wú)菌一次性移液管吸取。      
6)管子打開(kāi)前都要簡(jiǎn)短離心以減少氣溶膠的產(chǎn)生,而且管子不能用力崩開(kāi),這樣會(huì )產(chǎn)生氣溶膠。      
7)任何時(shí)候都應該穿實(shí)驗服和帶手套,手套要經(jīng)常更換,尤其在抽提過(guò)程中每一步之間都要更換。實(shí)驗服要專(zhuān)門(mén)用于樣品準備間,經(jīng)常清洗。     
2、樣品準備和RNA-PCR
      RNA-PCR的額外步驟需要額外的樣品操作,這樣增加了樣品之間污染的機會(huì )。為了避免這一問(wèn)題,反轉錄一步可以在樣品準備區進(jìn)行。在RNA-PCR中應用UNG以防止污染的方法也有報道。     
3、前PCR區      
必須有專(zhuān)門(mén)用于準備各種反應的區域,這個(gè)區域必須保持干凈,而且沒(méi)有來(lái)自克隆和樣品準備的污染。前PCR區必須要有試劑和準備,特別是專(zhuān)門(mén)用于前PCR區的正壓活塞式移液管。      
4、PCR實(shí)驗室試劑的操作      
1)所用的所有溶液都應該沒(méi)有核酸和(或)核酸酶(DNase和RNase)污染。     
2)所有PCR試劑中使用的水都應該是高質(zhì)量的-新鮮蒸餾的去離子水,用0.22μm過(guò)濾的,并且是高壓滅菌。      
3)在20℃到25℃貯存的試劑建議加點(diǎn)像疊氮鈉一類(lèi)的抗微生物劑,在擴增試劑或樣品制備試劑中加入0.025%的疊氮鈉不抑制擴增反應。     
4)所用試劑都應該以大體積配制,實(shí)驗一下看試劑是否滿(mǎn)意,然后分裝成僅夠一次使用的量進(jìn)行貯存。      
5)所有試劑和樣品準備過(guò)程中都要使用一次性滅菌的瓶子和管子。     
6)新配制的試劑在用于準備新的標本之前應該加以檢驗。      
7)樣品準備和前PCR區所使用的移液管在不使用時(shí)都應該小心保存。     
5、在前PCR區建立PCR混合物      
1)可以把即刻可用的“主混合物”溶液配好、分裝并保存在-20℃或4℃,在實(shí)驗室只涉及到擴增一種或少數幾種特異序列時(shí)這樣做很有用。      
2)如果你的實(shí)驗室使用多套引物,以致于配制包括所有試劑的單一反應混合物不夠經(jīng)濟,可以考慮分裝保存夠一天的PCR成分。      
3)作為一個(gè)規則,應該保存一套陰性、弱陽(yáng)性和強陽(yáng)性對照樣品來(lái)分析樣品配制和PCR前過(guò)程的效率和潔凈程度。而且,你也希望通過(guò)使用一個(gè)已知的弱陽(yáng)性樣品來(lái)驗證你的樣品緩沖液以證明里面不含擴增抑制物。      
4)陰性樣品要與每組樣品同時(shí)做,以分析是否存在樣品與樣品之間的污染以及是否存在PCR產(chǎn)物的污染,陰性對照應該包括核酸以外的所有試劑。      
5)當做陽(yáng)性對照時(shí),有兩個(gè)理由決定了應該使用最少數量的核酸。     
6)由于必須有對照反應,對照模板的特點(diǎn)應該予以考慮。
6、控制污染的方法      
已設計出很有力的酶學(xué)方法用來(lái)消除一種形式的污染—使用UNG,這一技術(shù)能有效地消除由PCR產(chǎn)物引起的污染。另一種控制污染的方法是使用紫外線(xiàn),這種方法不能完全消除污染問(wèn)題,但可以將污染降低幾個(gè)數量級。     
7、PCR儀的位置     
8、后PCR區      
PCR完成以后,需要分析樣品并解釋數據,應該留出一個(gè)專(zhuān)門(mén)用于反應后處理樣品的地方。后PCR活動(dòng)中使用的所用試劑、一次性耗材和儀器都必須是專(zhuān)門(mén)用于這一目的,決不能把實(shí)驗室這一區域的試劑或儀器用于任何前PCR活動(dòng)

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